Алгоритм использует геномы двух видов животных, сопоставляет генетические коды и определяет схожие участки. Таким образом удается найти родственников представителей фауны. Результаты научной работы и принцип действия программы были описаны на сайте GigaScience. Ученые назвали свою разработку halSynteny. Ксения Крашенинникова, являющаяся одним из авторов работы, объяснила, что программа делает точное сравнение аминокислот и белков.
Первое установление родственных связей было проведено на домашних питомцах — кошках и собаках. Разработка американских и российских ученых показала, что геном кошек был менее подвержен изменениям в ходе эволюции, в отличие от собак.