Группа исследователей, куда вошли ученые Центра геномной биоинформатики имени Ф. Г. Добржанского СПбГУ, впервые в мире расшифровала геном гриба Fusarium oxysporum f.sp. lini. Этот паразит атакует лен, а также является близким родственником гриба, вызывающего «панамскую болезнь» у бананов, которая за последние 70 лет полностью уничтожила несколько сортов. Новые данные помогут понять, как защитить лен от «бананового» сценария, а в перспективе — избавить от вредоносного гриба и другие сельскохозяйственные культуры.
Руководитель лаборатории «Математическая биология и биоинформатика» СПбПУ Мария Самсонова отмечает, что использование современных омиксных технологий в сочетании с биоинформатикой позволит пролить свет на механизмы взаимодействия патогена с растением и благодаря этому сократить время получения устойчивых сортов. Кроме того, важным направлением, по ее мнению, является изучение коллекции устойчивых и восприимчивых сортов льна Центра лубяных культур. Эксперт заметила, что фузариоз — это системное заболевание, включающее быстрый ответ растения на инфекцию, поэтому без детального понимания механизмов такого ответа паразит всегда будет опережать селекционеров в «гонке вооружений».
Следующий шаг исследователей — сравнить геном льняного паразита с известными геномами паразитических грибов из этого же рода, но поражающих другие растения. Ученые попытаются найти генетическую причину того, почему одному штамму больше «нравится» атаковать дыни, а другому — помидоры. Это позволит выяснить конкретные биохимические механизмы адаптации паразита и, что самое важное, найти гены, которые за них отвечают. Если это удастся, то с помощью технологий редактирования генома можно будет создать новый сорт льна, устойчивый к фузариозу.